屬性指的是數碼寶貝所代表的電腦檔案類型。在虛擬寵物中，屬性有時也稱為「類型」。目前共有六種不同的屬性：
| 属性 | 日文 | 英文 | 罗马文 | 缩写 |
|---|---|---|---|---|
| 疫苗种 | ワクチン | Vaccine | Wakuchin | Va |
| 数据种 | データ | Data | Dēta | Da |
| 病毒种 | ウィルス | Virus | Wirusu | Vi |
| 自由种 | フリー | Free | Furī | |
| 可变种 | バリアブル or ヴァリアブル | Variable | Bariaburu or Variaburu | Ba |
| 不明/未知 | 不明 | Unknown | Fumei | 不明 |
數碼寶貝一般可依其對環境的影響分為三種屬性：「資料種」、「疫苗種」和「病毒種」。擁有相同名稱但屬性不同的數碼寶貝，有時外觀會有所不同，有些甚至會擁有不同的攻擊方式或類型。此外，還存在與「古代種」數碼寶貝有關的「自由種」和「可變種」屬性。具有「可變種」屬性的數碼寶貝，目前來看大多為「混合型」，其屬性會根據對手而變化。
屬性相剋關係如下：
- 疫苗種通常對病毒種具有優勢
- 病毒種通常對資料種具有優勢
- 資料種通常對疫苗種具有優勢
在更廣義的層面上，這些屬性也能代表性格類型，主要集中於三大主屬性：
疫苗種： 被創造出來的目的是為了防止病毒種破壞重要資料。牠們對病毒種具有強烈的攻擊本能，因此會主動對抗病毒種，從而保護周遭環境及自己的領域。通常而言，疫苗種數碼寶貝多為正派角色，重視正義與道德，致力於打擊邪惡。
資料種： 像是透過電腦傳送的電子郵件一樣，資料種不屬於疫苗或病毒，但需要疫苗種來保護自己免受病毒侵害。牠們順應已建立的環境而存在，並不傾向主動改變世界。資料種數碼寶貝可能是善也可能是惡，但普遍來說重視和平。
病毒種： 是會吞噬資料、破壞電腦數據的邪惡數碼寶貝。病毒種企圖依照自身的願望改造周圍環境，導致系統中出現異常。病毒種數碼寶貝渴望力量，並常為追求力量而變得貪婪、自私、兇暴甚至邪惡。
屬性相同的數碼寶貝之間通常會相處得不錯。不過，上述描述並非絕對，也曾出現過英雄般的病毒種，以及邪惡的疫苗種數碼寶貝。
屬性系統最初是在虛擬寵物裝置中，以類似「剪刀、石頭、布」的方式來決定勝負。這套機制在多數媒體中（尤其是卡片遊戲）仍然存在，但其影響力已不如以往那麼強烈。
在遊戲《數碼寶貝 絕境求生》中，獸化眾則分為：
- 道德（Moral） → 相當於 疫苗種
- 協調（Harmony） → 相當於 資料種
- 憤怒（Wrathful） → 相當於 病毒種
- 自由（Free） → 相當於原本的自由屬性